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魔兽争霸3冰封王座:轉錄輔助因子對不同類型的核心啟動子具有特異性

2019-5-28 作者:佚名   來源:細胞 我要評論0

轉錄輔助因子(transcriptional cofactor, COF)在增強子與啟動子之間傳遞調控線索,是轉錄激活和基因表達的核心效應物。雖然已證實某些COF比其他COF更偏好某些啟動子類型,但是不同COF對不同啟動子顯示出的內在特異性的程度尚不清楚。

在一項新的研究中,來自奧地利維也納生物中心分子病理學研究所的研究人員在黑腹果蠅S2細胞中使用高通量啟動子活性測定來篩選23個COF激活7.2萬個候選核心啟動子(core promoter, CP)的能力。相關研究結果于2019年5月15日在線發表在Nature期刊上,論文標題為“Transcriptional cofactors display specificity for distinct types of core promoters”。

這些研究人員觀察到核心啟動子的差異激活,這表明COF與特定類型的核心啟動子之間存在著不同的調節偏好或者說“兼容性(compatibilities)”。這些功能不同的核心啟動子在TATA盒、下游啟動子元件(downstream promoter element, DPE)和TCT基序等已知的序列元件上差異性地富集,并在內源性位點上顯示出不同的染色質特性。

值得注意的是,這些核心啟動子類型在它們的H3K4me3和H3K4me1標記上存在不同的相對豐度,這表明這些組蛋白修飾可能能夠區分反式調節因子而不是啟動子和增強子類型的順式調節元件。

這些研究人員證實在人細胞和另外兩種果蠅細胞中證實了不同COF-核心啟動子兼容性的存在。為此,他們發現了分別偏好TATA盒和CpG島啟動子的COF。COF和核心啟動子之間的不同兼容性能夠解釋不同的增強子如何特異性地激活不同組的基因、相同基因內的可變啟動子(alternative promoter)和相同啟動子內的不同轉錄起始位點。

綜上所述,COF-核心啟動子兼容性可能是果蠅和人類等不同物種中不同轉錄程序的基礎。

原始出處:
Haberle V1, Arnold CD1, Pagani M1, et al.Transcriptional cofactors display specificity for distinct types of core promoters.Nature. 2019 May 15. doi: 10.1038/s41586-019-1210-7. [Epub ahead of print]



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